Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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