Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UBA6A0AVT1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UBA6A0AVT1 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms