Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4BQ9Y4P1 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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ATG4BQ9Y4P1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ATG4BQ9Y4P1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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