Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MBD5Q9P267 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms