Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GOPCQ9HD26 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GOPCQ9HD26 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms