Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
AMBRA1Q9C0C7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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AMBRA1Q9C0C7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
AMBRA1Q9C0C7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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