Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM4Q9C037 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms