Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM8Q9BZR9 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRIM8Q9BZR9 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms