Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005224.1-201ENST00000458492 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUP43-203ENST00000367404 1089 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00443-201ENST00000421601 1170 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005726.6-201ENST00000579019 1083 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
KRTAP9-3Q9BYQ3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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