Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC46A2Q9BY10 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms