Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SEC22CQ9BRL7 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms