Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SEMA3CQ99985 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms