Protein–RNA interactions for Protein: Q99435

NELL2, Protein kinase C-binding protein NELL2, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL2Q99435 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NELL2Q99435 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms