Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SENP8Q96LD8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms