Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP47Q96K76 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP47Q96K76 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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