Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HDAC11Q96DB2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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