Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113Q902F9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms