Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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C11orf40Q8WZ69 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
C11orf40Q8WZ69 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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