Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH2

JPH3, Junctophilin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH3Q8WXH2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JPH3Q8WXH2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms