Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NEDD1Q8NHV4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms