Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms