Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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MED27Q6P2C8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MED27Q6P2C8 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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