Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HFEQ30201 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms