Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GRIK4Q16099 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms