Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SSPNQ14714 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms