Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SMC1AQ14683 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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