Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DSC3Q14574 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms