Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPIDRQ14159 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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SPIDRQ14159 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIDRQ14159 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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