Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ALCAMQ13740 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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