Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
HTR4Q13639 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HTR4Q13639 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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