Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTP4A2Q12974 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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