Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTPRJQ12913 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.5 ms