Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLTCQ00610 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLTCQ00610 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms