Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPAP53621 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPAP53621 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPAP53621 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms