Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NESP48681 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NESP48681 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NESP48681 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NESP48681 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NESP48681 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NESP48681 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NESP48681 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NESP48681 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
NESP48681 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NESP48681 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NESP48681 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NESP48681 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NESP48681 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms