Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MTHFRP42898 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms