Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRPPRCP42704 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms