Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GPC1P35052 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GPC1P35052 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GPC1P35052 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GPC1P35052 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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