Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DNMT1P26358 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DNMT1P26358 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms