Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PTPRDP23468 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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