Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00032P0C843 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00032P0C843 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LINC00032P0C843 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms