Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM58BPP0C7Q3 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms