Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RHOP08100 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RHOP08100 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RHOP08100 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms