Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RDH16O75452 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RDH16O75452 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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