Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM6BO15054 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms