Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
USP17L12C9JPN9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms