Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms