Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
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