Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms