Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SCML1Q9UN30 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms